Am 1. Mai 1986 begann Michael Hoyer seine Tätigkeit als Stadtbauinspektoranwärter beim Straßen-, Brücken- und Tunnelbauamt der Landeshauptstadt Düsseldorf. Zum 1. Januar 1990 wurde er in den Geschäftsbereich der Stadt Neustadt am Rübenberge versetzt, am 1. Februar in den Dienstbereich der Stadt Bückeburg.
Zu seinem Aufgabenbereich „Fachdienst Tiefbau” zählen unter anderem der Neu- und Ausbau von Straßen, Brücken und Plätzen. Am 1. August 1998 wurde er vom Rat der Stadt Bückeburg zum Bauamtsrat ernannt. In seiner Freizeit engagiert sich Michael Hoyer mit Leidenschaft im Schützenbund Stadthagen und beim Historischen Schützenfest. Er ist verheiratet und hat zwei Söhne.